Cancer Biomarkers

Telefono: +390882 416571

Fax: +390882 413368

Email: f.bianchi@operapadrepio.it

Responsabile Laboratorio: Dott. Fabrizio Bianchi

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Presentazione

Con l'avvento dell'era della post-genomica è stato finalmente possibile svelare il profilo molecolare di molti tipi di tumore. L’analisi del trascrittoma del cancro ha inoltre permesso di analizzare quali sono e come vengono espressi i geni nelle cellule tumorali svelando l'esistenza di sottotipi molecolari in lesioni tumorali apparentemente identiche, che correlano con una differente prognosi oltre che con un’eterogenea risposta al trattamento. Sono state identificate anche alcune alterazioni genetiche ed epigenetiche che distinguono questi sottotipi molecolari e che li caratterizzano funzionalmente, spiegandone, almeno in parte, il comportamento più o meno aggressivo.

L'analisi del trascrittoma del cancro è perciò una strategia efficace per identificare i meccanismi molecolari alla base della progressione del cancro e per sviluppare nuovi biomarcatori tumorali.

Il nostro laboratorio utilizza una combinazione di approcci genomici, computazionali e funzionali per l’analisi del trascrittoma del cancro e per l’identificazione di biomarcatori tumorali, al fine di facilitare la diagnosi precoce del cancro e lo sviluppo di terapie mirate.

Patologie studiate:
Tumori solidi

Responsabile Laboratorio

Istruzione e formazione: Dottore in Science Biologiche (Università degli Studi di Milano), Dottore di ricerca in Biologia Cellulare e Molecolare (Università degli Studi di Milano).

Attività professionale: Ha lavorato presso l'Istituto FIRC di Oncologia Molecolare - IFOM (Milano), l'Università di Oxford (Oxford, Regno Unito) e presso il Programma di Medicina Molecolare dell'Istituto Europeo di Oncologia (Milano). Dal 2016 è Responsabile dell'Unità Cancer Biomarkers dell’IRCCS Fondazione Casa Sollievo della Sofferenza. Ha maturato diversi anni di esperienza di ricerca nel campo della genomica del cancro e dello sviluppo di biomarcatori, in particolare nel campo dei microRNA circolanti e dell’analisi del trascrittoma del cancro. È inventore di brevetti internazionali riguardanti strumenti diagnostici e prognostici per lo screening del cancro del polmone (US8747867B2; US20150057159A1; US20160068913A1). È membro attivo dell'Associazione Americana per la Ricerca sul Cancro (AACR), dell'Associazione Europea per la Ricerca sul Cancro (EACR), della Società Italiana per la Ricerca sul Cancro (AIRC) e della Società Italiana di Cancerologia (SIC), per la quale ricopre la carica di segretario e membro del consiglio direttivo.

Area scientifica di interesse: Trascrittoma dei tumori solidi e biomarcatori tumorali

Collaborazioni: Istituto Europeo di Oncologia, IRCCS San Raffaele di Milano, Università degli Studi di Milano, Istituto di Nanotecnologia – CNR di Lecce, Università Roma Tre, Università di Navarra (Spagna), Fred Hutchinson Cancer Research Center (USA).

Equipe

PostDoc:

Dott. Tommaso Colangelo (t.colangelo@operapadrepio.it)
Dott. Roberto Cuttano (r.cuttano@operapadrepio.it)
Dott.ssa Valentina Melocchi (v.melocchi@operapadrepio.it)

Staff Scientist:

Dott.ssa Elisa Dama (e.dama@operapadrepio.it)

Studente di Dottorato di Ricerca:
Dott. Francesco Mazzarelli (f.mazzarelli@operapadrepio.it)

Ricercatore:

Dott.ssa Kuku Afanga (k.afanga@operapadrepio.it)

Tecnico:

Dott.ssa Patricia Kiptiu (p.kiptiu@operapadrepio.it)

Studente tirocinante:

Rosa Maria Perrone

Pubblicazioni

Totale pubblicazioni a partire dal 2011: n. 42

Elenco pubblicazioni (Più rilevanti):

  1. Colangelo T, Carbone A, Mazzarelli F, Cuttano R, Dama E, Nittoli T, Albanesi J, Barisciano G, Forte N, Palumbo O, Graziano P, di Masi A, Colantuoni V, Sabatino L, Bianchi F*, Mazzoccoli G*. Loss of circadian gene Timeless induces EMT and tumor progression in colorectal cancer via Zeb1-dependent mechanism. Cell Death Differ. 2022 Jan 15. doi: 10.1038/s41418-022-00935-y. Epub ahead of print. PMID: 35034102. * co-last authorship
  2. Dama E, Colangelo T, Fina E, Cremonesi M, Kallikourdis M, Veronesi G, Bianchi F. Biomarkers and Lung Cancer Early Detection: State of the Art. Cancers (Basel). 2021 Aug 3;13(15):3919. doi: 10.3390/cancers13153919. PMID: 34359818; PMCID: PMC8345487.
  3. Melocchi V, Dama E, Mazzarelli F, Cuttano R, Colangelo T, Di Candia L, Lugli E, Veronesi G, Pelosi G, Ferretti GM, Taurchini M, Graziano P, Bianchi F. Aggressive early-stage lung adenocarcinoma is characterized by epithelial cell plasticity with acquirement of stem-like traits and immune evasion phenotype. Oncogene. 2021 Aug;40(31):4980-4991. doi: 10.1038/s41388-021-01909-z. Epub 2021 Jun 25. PMID: 34172935.
  4. Barisciano G, Colangelo T, Rosato V, Muccillo L, Letizia Taddei M, Ippolito L, Chiarugi P, Galgani M, Bruzzaniti S, Matarese G, Fassan M, Agostini M, Bergamo F, Pucciarelli S, Carbone A, Mazzoccoli G, Colantuoni V, Bianchi F*, Sabatino L*. miR-27a is a master regulator of metabolic reprogramming and chemoresistance in colorectal cancer. Br J Cancer. 2020 Mar 5. doi: 10.1038/s41416-020-0773-2. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 32132656. * co-last authorship
  5. Lusito E, Felice B, D'Ario G, Ogier A, Montani F, Di Fiore PP, Bianchi F. Unraveling the role of low-frequency mutated genes in breast cancer. Bioinformatics. 2018 Jun 29. doi: 10.1093/bioinformatics/bty520
  6. Monterisi S, Lo Riso P, Russo K, Bertalot G, Vecchi M, Testa G, Di Fiore PP, Bianchi F. HOXB7 overexpression in lung cancer is a hallmark of acquired stem-like phenotype. Oncogene. 2018 Jun;37(26):3575-3588. doi: 10.1038/s41388-018-0229-9.
  7. Dama E, Melocchi V, Dezi F, Pirroni S, Carletti RM, Brambilla D, Bertalot G, Casiraghi M, Maisonneuve P, Barberis M, Viale G, Vecchi M, Spaggiari L, Bianchi F*, Di Fiore PP*. An Aggressive Subtype of Stage I Lung Adenocarcinoma with Molecular and Prognostic Characteristics Typical of Advanced Lung Cancers. Clin Cancer Res. 2017 Jan 1;23(1):62-72. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-15-3005. * co-last authorship
  8. Montani F, Bianchi F. (2016) Circulating Cancer Biomarkers: The Macro-revolution of the Micro-RNA. EBioMedicine. 2016 Feb 28;5:4-6. doi: 10.1016/j.ebiom.2016.02.038. eCollection 2016 Mar.
  9. Montani, F., Marzi, M., Dezi, F., Dama, E., Carletti, R., Bonizzi, G., Bertolotti, R., Bellomi, M., Rampinelli, C., Maisonneuve, P., Spaggiari, L., Veronesi, G., Nicassio, F., Di Fiore, PP., Bianchi, F. (2015) miR-Test: a blood test for lung cancer early detection, Journal of the National Cancer Institute 107(6), doi:10.1093/jnci/djv063
  10. Bianchi F, Nicassio F, Marzi M, Belloni E, Dall'olio V, Bernard L, Pelosi G, Maisonneuve P, Veronesi G, Di Fiore PP. A serum circulating miRNA diagnostic test to identify asymptomatic high-risk individuals with early stage lung cancer. EMBO Mol Med. 2011 Aug;3(8):495-503. doi: 10.1002/emmm.201100154.

Progetti di Ricerca Attivi

Anno di Avvio: 2020
Durata: 5 anni
Ente Finanziatore: Associazione Italiana Ricerca sul Cancro (AIRC). Codice progetto: Investigator Grant id.22827
Project Leader: Fabrizio Bianchi
Principal Investigator: Fabrizio Bianchi

Anno di Avvio: 2020
Durata: 3 anni
Ente Finanziatore: Ministero della Salute. Codice progetto: GR-2019-12370460
Project Leader: Tommaso Colangelo
Principal Investigator: Tommaso Colangelo

Anno di Avvio: 2019
Durata: 3 anni
Ente Finanziatore: Ministero della Salute. Codice progetto: GR-2016-02363975
Project Leader: Fabrizio Bianchi
Principal Investigator: Fabrizio Bianchi

Anno di Avvio: 2018
Durata: 3+1 anni
Ente Finanziatore: ERA-NET
Project Leader: Giulia Veronesi (Ospedale San Raffaele, Milano)
Principal Investigator: Fabrizio Bianchi
Project Team: Giulia Veronesi (Ospedale San Raffaele, Milano), Fabrizio Bianchi, Thomas Dandekar (University of Würzburg), Witold Rzyman (Medical University of Gdansk), Patrizia Paterlini-Brechot (University Paris Descartes), Philippe Lambin (Maastricht University), Harry De Koning (Erasmus MC, University Medical Center Rotterdam).

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